НОВОСТИ КОМПАНИИ
Патенты на способ и устройство секвенирования в РФ и США
Дорогие друзья!
Рады сообщить, что мы получили патент на "Способ безметочного одномолекулярного секвенирования ДНК и устройство для его реализации" в США!
В патенте предложен способ и устройство для определения нуклеотидной последовательности молекулы нуклеиновой кислоты.Предоставление услуг
Дорогие друзья!
Мы стали Центром компетенций и будем рады предложить услуги в направлениях:
Геномика, молекулярная биология (ПЦР-тесты, разработка маркеров, заказные НИОКР и экспертиза)
Наноэлектроника и сенсорика (заказные НИОКР, измерения, тестирование наноэлектронных технологий/сенсоров/структур
Алгоритмистика и программное обеспечение (заказная разработка систем диагностики, биолсенсорных систем, систем автоматизации любой сложности)
Технологический консалтинг (биомед, аналоговые системы)
Полный перечень услуг можно увидеть в разделе "Наши услуги".
Следите за нашими новостями на сайте и на странице FB.
Демонстрация работы программы по восстановлению нуклеотидной последовательности олигонуклеотида на модельных данных.
Дорогие друзья!
В настоящее время завершается отладка макета ключевых узлов секвенатора ДНК, необходимого для проведения экспериментов по секвенированию заказного олигонуклеотида, результаты которого будут формироваться и демонстрироваться программой, которую мы для этой задачи разработали. Сегодня мы предоставляем возможность посетителям сайта познакомиться с работой этой программы на примере синтезированных данных, которые эмулируют данные по секвенированию заказного олигонуклеотида макетом ключевых узлов секвенатора ДНК.
Программа реализует оригинальный диффузный алгоритм секвенирования нуклеиновых кислот, который работает с четырьмя файлами исходных данных. Данные для этих файлов формируются посредством оцифровки сигнала сенсора, который регистрирует факты разделения зарядов в результате встраивания (иммобилизованной на поверхности сенсора) полимеразой каждого нуклеотида в ходе реакции полимеризации закольцованного одноцепочечного олигонуклеотида поочередно в четырех различных рабочих растворах, соответственно. Рабочие растворы нуклеозидтрифосфатов поочередно подаются на поверхность сенсора, причем каждый из растворов имеет один вид нуклеозидтрифосфатов, молекулы которого находятся в концентрации, ограничивающей темп синтеза заказного олигонуклеотида. Согласно алгоритму секвенирования, в среднем, интервалы времени длиннее перед встраиванием нуклеотидов вида, концентрация которого была понижена против нормальной концентрации нуклеотидов трех других видов в рабочем растворе. Т.к. на этапе пробоподготовки известно имя вида нуклеотидов, концентрация которого понижена для каждого рабочего раствора, то средствами программного обеспечения макета ключевых узлов секвенатора ДНК формируются временные последовательности регистрации сенсором результатов синтеза олигонуклеотида для каждого рабочего раствора в форме последовательности дискретных интервалов времени, содержащих логические единицы «1» и логические нули «0»; причем логической единицей «1» обозначен тот интервал времени, который соответствует встраиванию нуклеотидов, а логическим нулем «0» обозначаются те интервалы времени, когда результаты реакции зафиксированы не были. Полученные таким образом последовательности логических единиц «1» и логических нулей «0» записываются в четыре файла, соответствующие четырем рабочим растворам. Программа последовательно обрабатывает данные в четырех файлах, по оригинальному алгоритму устанавливает пороговое значение интервала времени для временной последовательности каждого файла; с пороговым значением сравниваются все интервалы времени между логическими единицами «1» на временной последовательности и сортируются на длинные и короткие. Длинные интервалы времени соответствуют встраиванию известных нуклеотидов, нуклеотидов того вида, концентрация которых была понижена в рабочем растворе.
С работой программы вы можете познакомиться, посмотрев видеоролик, который мы специально для этого записали.
Программа демонстрирует сборку нуклеотидной последовательности заказного олигонуклеотида на модельных данных; данные для этой же Программы, но полученные путем оцифровки сигналов, которые формируются сенсором в результате регистрации фактов разделения пар зарядов в ходе реакции полимеризации заказного олигонуклеотида на макете ключевых узлов секвенатора ДНК, будут предоставлены в ближайшем будущем, и также будут использованы программой для сборки и демонстрации нуклеотидной последовательности заказного олигонуклеотида.
Следите за нашими новостями на сайте и на странице FB.
Завершился прием заявок на Конкурс на лучшее название для нашего секвенатора ДНК!
Дорогие друзья!
Спасибо всем, кто принял участие в Конкурсе на лучшее название для нашего секвенатора ДНК!
В соответствии с условиями Конкурса, наша команда приступает к оценке результатов. Напомним, что процесс выбора победителя состоит из следующих этапов:
Этап 1. Предварительная балльная оценка командой всех предложенных вариантов, выбор топ-10 названий, набравших максимальное количество баллов
Этап 2. Предварительная проверка возможности регистрации топ-10 вариантов в качестве российского и международного товарных знаков
Этап 3. Финальная балльная оценка командой названий, успешно прошедших Этап 2
Этап 4. Определение названия, набравшего наибольшее количество баллов по результатам Этапа 3
Этап 5. Регистрация российского и международного товарных знаков
Этап 6. Определение Победителя
Этап 7. Уведомление Победителя (по адресу электронной почты, с которого было направлено название, признанное лучшим) о его победе и получение Победителем сертификата, гарантирующего право на ПРИЗ (как определено в Оферте)
Результаты каждого из этапов будут опубликованы на нашем сайте.
Успехов участникам!
Мы получили патент!
Работа лаборатории & Объявление Конкурса на лучшее название секвенатора
Сегодня мы публикуем видео о работе нашей лаборатории в России (в Сколково).
А также объявляем Конкурс на лучшее название для нашего секвенатора ДНК!
Приятного просмотра!
Условия Конкурса изложены под видеороликом.
01.02.2019 – 31.03.2019 – Конкурс на лучшее название для секвенатора ДНК!
Друзья!
Мы объявляем Конкурс на лучшее название для нашего секвенатора. Присылайте ваши идеи на адрес электронной почты contest@gamma-dna.com. На этот же адрес можно направить любые возникающие вопросы в отношении Конкурса.
ПРИЗ Победителю: полногеномное секвенирование ДНК на нашем приборе + интерпретация данных! Вы получите полную информацию о рисках заболеваний, включая наследственные (бесценные данные для персонализированной медицины – лечения с учетом полного комплекса индивидуальных особенностей пациента); анализ предрасположенностей к тем или иным видам деятельности; рекомендации по персональному питанию и фитнесу; анализ генеалогии.
Ключевое:
- количество предлагаемых вариантов не ограничено
- возможность представить свои варианты анонимно, либо от своего имени – на ваш выбор
- рассматриваются только варианты, поступившие в срок и на указанный адрес электронной почты, в теме письма укажите слово «Конкурс»
Процесс выбора Победителя:
Этап 1. Предварительная балльная оценка командой всех предложенных вариантов, выбор топ-10 названий, набравших максимальное количество баллов
Этап 2. Предварительная проверка возможности регистрации топ-10 вариантов в качестве российского и международного товарных знаков
Этап 3. Финальная балльная оценка командой названий, успешно прошедших Этап 2
Этап 4. Определение названия, набравшего наибольшее количество баллов по результатам Этапа 3
Этап 5. Регистрация российского и международного товарных знаков
Этап 6. Определение Победителя
Этап 7. Уведомление Победителя (по адресу электронной почты, с которого было направлено название, признанное лучшим) о его победе и получение Победителем сертификата, гарантирующего право на ПРИЗ (как определено в прилагаемой Оферте)
Критерии выбора лучшего названия:
Полное отсутствие критериев! :) Все знают множество примеров успешных брендов, как с продуманными названиями, так и с названиями из случайных комбинаций букв. Мы не исключение: команда ООО «ГАММА-ДНК» достаточно диверсифицирована, чтобы быть репрезентативной при оценке названий. Поэтому, единственный вопрос, на который будут отвечать члены команды – это: «Насколько мне нравится данное название по 10-балльной шкале?»
И всё же:
Конечно, название должно быть благозвучным при его транскрипции латиницей – ведь секвенатор будет представлен на международных рынках!
ПЕРЕД УЧАСТИЕМ В КОНКУРСЕ ОЗНАКОМЬТЕСЬ С ПУБЛИЧНОЙ ОФЕРТОЙ И ПОЛИТИКОЙ КОНФИДЕНЦИАЛЬНОСТИ. УЧАСТИЕ В КОНКУРСЕ ОЗНАЧАЕТ ВАШЕ ОЗНАКОМЛЕНИЕ И ПРИНЯТИЕ УСЛОВИЙ, УКАЗАННЫХ В ДАННЫХ ДОКУМЕНТАХ.
Оферта Политика конфиденциальностиОбразец сертификатаУСПЕХОВ!
Команда ООО «ГАММА-ДНК»
Об итогах 2018 года
Получено свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2018611229 «Программа логико-математического 3D моделирования реакции полимеризации ДНК»
Февраль:
По итогам экспертизы и питча проекта, Грантовый комитет Фонда одобрил предоставление грантового финансирования ООО «ГАММА-ДНК»
Март:
Подана патентная заявка на международный статус (PСТ) на изобретение «Способ безметочного одномолекулярного секвенирования ДНК и устройство для его реализации»
Апрель-май:
Активное взаимодействие с инвесторами (бизнес ангелы и фонды) и партнерами (Zethea, МГУ, Наутех, ТФК «Сколково», ЦИС «Сколково») по предстоящему раунду, согласование условий инвестиций и кооперации с партнерами
Июнь:
Структурирование сделки, закрытие этапа 1 pre-seed раунда; к проекту присоединилось 4 бизнес-ангела, привнеся дополнительные компетенции в области искусственного интеллекта, нанотехнологий и финансов
Июль:
Плановый старт разработки в рамках pre-seed раунда; закупка необходимого оборудования и подготовка лаборатории; разработка технических заданий на полимеразу и сенсоры и их согласование с партнерами; заключение договоров о кооперации с партнерами
Старт разработки всех технических требований и методик, экспериментальной конструкторской документации на сенсоры, микрофлюидное устройство, измерительный стенд, макет ключевых узлов секвенатора ДНК
Участие в профильном отраслевом мероприятии «2-я международная конференция «Bioinformatics: from algorithms to application» в Санкт-Петербурге
Август:
Открытие лаборатории, комплектация команды – наём биохимиков, инженеров, специалистов в области информационных технологий; активное вовлечение в работу менторов
Старт подготовки технических требований на проектирование прототипа матрицы ячеек сенсоров по стандартной технологии TSMC
Сентябрь:
Технологическая, юридическая и бизнес экспертиза проекта фондом G&S I Fund LP (США) на предмет возможного инвестирования Этапа 2 pre-seed раунда
Разработка физико-математической модели формирования сигнала сенсором
Октябрь:
Принятие фондом G&S I Fund LP (США) положительного решения об участии в проекте и внесении инвестиций в ООО «ГАММА-ДНК».
Charles Edward Shearer, General Partner, G&S I Fund LP (США):
Надежда Матвеева, Управляющий партнер по развитию и инвестициям, ООО «ГАММА-ДНК»:
"Для нас G&S I Fund LP, в первую очередь, важный стратегических партнер – как с точки зрения содействия в выходе на зарубежные рынки, так и в вопросах привлечения зарубежных инвестиций в ходе последующих раундов. Рынок США в большой степени монополизирован лидером (Illumina) и изначально не входил в нашу стратегию продвижения на зарубежные рынки. Но при содействии команды G&S I Fund LP вопрос представительства в США вполне может быть рассмотрен. Ключевой нашей задачей на сегодня становится обеспечение для всех участников компании оптимального баланса между привлекаемым объемом инвестиций и наращиванием темпов разработки для целей сокращения времени до выхода на рынок."
Разработка технологического регламента для изготовления двух вариантов сенсоров
Разработка аналого-цифровой схемы и топологии обработки сигнала для зарядочувствительной ячейки матрицы по технологии TSMC
Участие в 7-ом Московском международном форуме «Открытые инновации», 1е место в HealthNet НТИ единогласно! Подробнее здесь.
Ноябрь:
Получена первая партия полимеразы, изготовленная по техническому заданию ООО «ГАММА-ДНК», от Zethea. Полимераза соответствует плановым характеристикам, хранится в морозильнике Технопарка Сколково.
Получены прототипы двух вариантов сенсоров, изготовленных МГУ по техническому заданию ООО «ГАММА-ДНК». Параметры сенсоров измерены и соответствуют плановым.
Разработка программы испытаний макета ключевых узлов секвенатора ДНК
Старт разработки программного обеспечения управления блоками макета ключевых узлов секвенатора ДНК и программного обеспечения формирования и демонстрации результатов секвенирования фрагмента ДНК макетом ключевых узлов секвенатора ДНК
Декабрь:
Изготовлен и апробирован измерительный стенд, который предназначен для тестирования на пригодность к работе двух вариантов сенсоров, для измерения значений электрических параметров этих сенсоров, - с целью выбора наилучших из них по измеренным параметрам для применения в качестве биосенсоров в последующих экспериментах с биологическим материалом.
Разработана концепция проведения экспериментов по демонстрации результатов секвенирования заказного олигонуклеотида. Последний уже получен и хранится в морозильнике.
Оформлены ноу-хау на методику подготовки образцов ДНК для применения в одномолекулярном секвенировании ДНК и методику оригинального алгоритма одномолекулярного секвенирования ДНК.
Михаил Гуторов, Генеральный директор ООО «ГАММА-ДНК»:
"С точки зрения технологического развития и разработки 2018 год позволил существенно продвинуться и приблизить день демонстрации сиквенса заказного олигонуклеотида на макете ключевых узлов нашего секвенатора ДНК. Выполнены плановые задачи в части разработки и развития, с опережением плановых сроков подана патентная заявка на международный статус (РСТ) на изобретение «Способ безметочного одномолекулярного секвенирования ДНК и устройство для его реализации». Каждым лидером сформирована команда специалистов по курируемым направлениям, успешно прошедших испытательный срок. На сегодня штатная численность составляет 17 человек, также с нами работает научный консультант и 2 ментора. Лаборатория оснащена всем необходимым оборудованием. С такими результатами, силами и ресурсами мы уверенно шагнули в 2019 год!"
ООО "ГАММА-ДНК" - 1-ое место в HealthNet на Открытых инновациях 2018!
На входе
На выходе
Разработка полимеразы: мы стартовали – в партнерстве с Zethea
